ارزیابی روابط فیلوژنتیکی گونه ‏های trichoderma به دست آمده از شالیزارهای استان مازندران بر اساس توالی‏های ژن tef۱α

جنس trichodermaاز مهم‏ترین جنس‏های قارچی در زمینه کنترل بیولوژیک بیماری‏های گیاهی، افزایش رشد و القای مقاومت در گیاهان به شمار می‏رود. ارتباط فیلوژنتیکی 81 جدایه‏ متعلق به شش گونه از این جنس (شامل چند جدایه بیوکنترل امید بخش) که از مزارع برنج استان مازندران به دست آمده‏اند، بر اساس توالی قطعه‏ای از ژن αtef1بررسی شد. توالی‏های‏ ژن مذکور در جدایه‏های مورد آزمایش به همراه توالی‏های به دست آمده از بانک ژن هم‏ردیف‏سازی شدند و تجزیه و تحلیل داده‏ها با روش‏های پیوست همسایه ها، پارسمونی بیشینه و تکامل کمینه انجام شد. نتایج نشان داد که جدایه‏های متعلق به t. harzianum (فراوان‏ترین گونه شالیزار در این تحقیق) 14 هاپلوتیپ مختلف را تشکیل دادند که در پنج گروه مجزا قرار گرفتند و بنابراین این گونه‏ی مرکب، بیشترین تنوع ژنتیکی را به نمایش گذاشت. جدایه‏های t. virens (دومین گونه‏ فراوان مزارع برنج مازندران در این بررسی) فقط در دو هاپلوتیپ گروه‏بندی شدند. گونه‏های t. atroviride و t. hamatum با سه و دو جدایه به ترتیب سه و دو هاپلوتیپ را تشکیل دادند. سویه‏های بیوکنترل متعلق به یک گونه دارای هاپلوتیپ‏های متفاوتی بودند و همراه با سویه‏های غیر آنتاگونیست در شاخه‏های جداگانه‏ای قرار گرفتند. در نتیجه، هاپلوتیپ منحصر به فردی از αtef1 که به خاصیت آنتاگونیسم مرتبط باشد، بر اساس تجزیه و تحلیل توالی αtef1تشخیص داده نشد. ارتباطی بین هاپلوتیپ و مکان جغرافیایی وجود نداشت و از یک مزرعه، گونه‏ها و هاپلوتیپ های مختلف جداسازی شدند.